Игумен Филарет (в миру –Авдюшкин Сергей Юрьевич) родился 15 апреля 1966 г. в г.Серафимович, Волгоградской области.
С мая 1984 г. по май 1986 г. проходил срочную военную службу в рядах Вооруженных сил.
В 1986 г. поступил в Новочеркасский техникум пищевой промышленности, который окончил в 1989 г.
26 сентября 1990 г. Преосвященным Сергием, епископом Азовским, викарием Ростовской-на-Дону епархии, рукоположен в сан диакона в Воскресенском соборе станицы Старочеркасской к Вознесенскому кафедральному собору г.Новочеркасска.
19 декабря 1990 г. Преосвященным Сергием, епископом Азовским, викарием Ростовской-на-Дону епархии, рукоположен в сан пресвитера в Вознесенском кафедральном соборе г. Новочеркасска к означенному храму.
В 1992 г. назначен настоятелем храма Казанской иконы Божией Матери в г.Гуково.
В 1995 г. поступил в Ставропольскую духовную семинарию, которую окончил по первому разряду в 1999 г.
23 марта 1997 г. по благословению Высокопреосвященнейшего Пантелеимона, архиепископа Ростовского и Новочеркасского, был пострижен в монашество с именем Филарет (в честь святителя Филарета, митрополита Московского) архимандритом Модестом (Потаповым), наместником Свято-Донского мужского монастыря станицы Старочеркасской.
5 октября 2005 г. назначен настоятелем Вознесенского кафедрального собора г. Новочеркасска.
В 2006 г. ко дню Святой Пасхи возведен в сан игумена.
Ко дню Святой Пасхи 2014 года Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом награжден крестом с украшениями.
14 октября 2015 года во внимание к трудам по реставрации Патриаршего Вознесенского войскового всеказачьего собора г.Новочеркасска Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом удостоен орденом преподобного Сергия Радонежского III степени.
2 ноября 2017 г. назначен настоятелем Константино-Еленинского храма г. Новочеркасска.
Награжден церковными наградами: орденом преподобного Сергия Радонежского III степени, юбилейной медалью «20 лет Общества сестер милосердия блаженной Ксении Петербургской 1999-2019», юбилейной медалью Донской митрополии Русской Православной Церкви «За усердное служение», медалью «За труды милосердия в борьбе с пандемией 2020».
Отмечен шестью наградами от Войскового казачьего общества «Всевеликое Войско Донское» «За возрождение Донского казачества», юбилейной медалью «450 лет служения Донских казаков государству Российскому».
В апреле 2021 г. присвоено звание «Почетный гражданин города Новочеркасска».
Постановлением Правительства Ростовской области от 18 октября 2021 года № 843 удостоен Памятным знаком «85 лет Ростовской области».